呛咳时，若用手捂住嘴，会导致上呼吸道压力急剧增大，使细菌由咽鼓管驱向中耳，引起中耳感染。

捂嘴还会使食物残渣呛入鼻腔，刺激鼻腔黏膜而打喷嚏。若遇刺激性较强的食物，会致鼻黏膜因强烈刺激而充血、水肿，发生鼻塞流涕甚至发炎。

呛咳时捂嘴，由于喉部压力增高，会使喉部较为疏松的软组织扩张，可能导致因损伤声带而窒息。