番木瓜既是果树，又是原料作物。成熟的果实，营养丰富，维生素C含量高，可助消化、治胃病。未成熟的青果，除可作蔬菜食用外，还可腌制蜜饯，制作果酱和果汁罐头，又是很好的饲料。青果含有丰富的木瓜蛋白酶，在医药、食品、制革、纺织及美容上广泛应用，是木瓜酶工业的主要原料。