这篇报道还引起美国微生物学家迈克·曼哈特的注意。他仔细阅读马歇尔发表的相关论文后，意识到重大商机的到来，因此邀请马歇尔到美国开展进一步研究，1986年马歇尔成为美国弗吉尼亚大学的一员。

马歇尔亲力亲为，积极倡导以采用抗生素为主的慢性胃病临床治疗方案，这在外人看来简直达到狂热的程度。马歇尔的新疗法使众多患者摆脱了病痛，以至美国每天的报纸上都有胃病患者治愈消息的故事刊登。患者纷纷捐款成立基金会，进一步普及和倡导慢性胃病治疗新知识，从而使越来越多的患者了解并接受新方案。

20世纪90年代，越来越多的证据也使学术界对马歇尔的态度有了根本性改变。1992年，马歇尔在学术会议上再次介绍自己的研究时，赞赏开始逐渐超越批评。1994年2月，美国国立卫生研究院最终达成共识，宣布胃溃疡诊断标准之一是幽门螺杆菌检测，治疗的关键是将幽门螺杆菌根除。这一事件也成为马歇尔发现的一个分水岭，科学界正式接受幽门螺杆菌是引发胃溃疡的病因。马歇尔在早期还发现胃癌患者通常也伴发幽门螺杆菌感染，因此推测二者之间也存在因果关系，美国将幽门螺杆菌明确列为致癌物，预示幽门螺杆菌的消灭对胃癌预防具有重要意义。

马歇尔还积极探索幽门螺杆菌的新型诊断方式。马歇尔发现幽门螺杆菌具有独特的代谢方式，可以将尿素分解为二氧化碳和氨，从而开发出一种幽门螺杆菌呼气测试法。今天医院常用的C‐13同位素呼吸试验就是基于此原理，就诊患者先服下C‐13同位素标记的尿素，如果存在幽门螺杆菌，就会有C‐13标记的二氧化碳生成和释放，通过检测呼出气体中的放射性水平来确定感染幽门螺杆菌的数量。

在马歇尔的推动下，科学界还积极寻求其他治疗幽门螺杆菌感染更理想的治疗方案。目前，临床上常用方案有三联和四联疗法，三联通常是拉唑类药物（如奥美拉唑）加两种抗生素（如克拉霉素与甲硝唑），四联则是在三联基础上加一种铋剂。